根据搜索结果，辉瑞公司（Pfizer）是获得过国际PCT专利的跨国制药公司之一。辉瑞公司在近10年中申请了300余件化合物PCT专利与生物制品基础PCT专利。这些专利申请反映了辉瑞公司在新药研发方面的重点方向，尤其是在抗肿瘤药和精神科用药领域。辉瑞公司的PCT专利申请量在2015年，但整体上呈逐年下降的趋势，这可能表明新药开发难度日益加大。辉瑞公司的小分子化合物专利申请占大多数，这显示了公司在小分子药物研发方面的实力。
除了辉瑞公司，还有其他许多药物公司也通过PCT途径申请了国际专利，以保护其在全球范围内的知识产权。这些公司可能包括但不限于诺华（Novartis）、罗氏（Roche）、默克（Merck）、强生（Johnson & Johnson）等，它们都是全球知名的制药企业，拥有大量的研发投入和专利申请。这些公司的PCT专利申请涵盖了生物技术、医疗技术和药品等多个领域。
需要注意的是，PCT专利申请是一个复杂且耗时的过程，涉及到多个国家和地区的专利局，以及世界知识产权组织（WIPO）的国际检索和审查。因此，能够成功获得PCT专利保护的公司通常在研发和知识产权管理方面具有较高的能力和资源。
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