环境DNA测序技术可应用于水、土壤和大气环境的监测,是评估生态环境状况和生物多样性的重要手段,也是环境科研领域的重要工具。

为了共同搭建环境DNA科研生态、聚焦组学研究热点,国内环境DNA检测领域领先企业凌恩生物,基于华大智造DNBSEQ-G99平台,推出eDNA metabarcoding(环境DNA宏条形码)检测项目。

eDNA(environmental DNA)即环境DNA,是指环境介质(土壤、水源、空气)中存在的DNA,在我们生存的环境内,到处都可能存在生物体释放的DNA(如毛发、粘液、唾液、尿液便等)。

利用高通量测序技术检测和分析环境样本中每个物种释放痕量DNA,可以在不破坏生态系统的情况下检测物种是否存在,或进行具体物种的种属鉴定。动态的eDNA检测,亦可研究生物多样性的动态变化、监测生态系统的演变等。基于高通量测序的eDNA检测技术具有高灵敏度、高分辨率、高效快速和低样本量需求的特点,已成为研究生态环境的强大工具,未来将赋能多个应用方向。

得益于“速度王者”DNBSEQ-G99 快速、灵活、简单、读长选择多样化等优势,凌恩生物基于G99平台,推出eDNA metabarcoding测序技术服务,在确保更快交付准确可靠检测数据的前提下,提升eDNA检测效率,降低相关项目的科研成本,更好服务于我国的环境生态工作。

01产品方案

eDNA多样本类型建库:

水体样本淡水鱼类eDNA检测,引物选择:Tele02,扩增子长度~200bp。

底泥样本水生植物eDNA检测,引物选择:rbcL,扩增子长度~520bp。

测序方案:

华大智造DNBSEQ-G99 (PE300测序)

分析方案:

凌恩生物配套eDNA分析方案

02检测流程

03eDNA检测物种的检出情况

无论是较短的扩增产物(如:淡水鱼类eDNA引物 Tele02),还是较长的扩增产物(如:水生植物eDNA引物 rbcL),利用G99平台均可以高灵敏度检测物种的存在状态。

注:测序方案及结果来源于凌恩生物


除了建库测序周期更短、检测更高效,G99平台还能满足较大范围的扩增子长度检测类型,尤其对较长片段扩增子检出及分类注释的效果好,可匹配多方向eDNA检测项目需求。

04凌恩生物基于G99测序平台eDNA项目特色

多种样本类型核酸提取方案

凌恩生物eDNA metabarcoding检测项目,针对水体、土壤、底泥、空气、动物消化道内容物等多种类型样本开发出特色eDNA核酸提取方案,解决eDNA含量极低微且难以获取的技术瓶颈,攻克多种类型eDNA研究方向,能够为广大生态研究科学家提供高效稳妥的eDNA研究办法。

数据急速交付效率

凌恩生物eDNA Metebarcoding技术,联合“速度王者”G99测序平台,开展PE300测序,测序步骤仅需30小时即可完成,可满足不同长度片段eDNA扩增子研究需求,适用于更多类型eDNA引物测序,可短时间内快速获得测序数据,极大程度压缩科研成本及科研时间,为科研用户提供更广阔的研究空间。

升级eDNA分析流程及个性化数据库定制

凌恩生物历经五年精心打磨eDNA专属分析流程。更大、更全面的鱼类物种注释数据库,目前包含淡水鱼类名录18686种,海水鱼类名录17828种,并增加濒危物种鱼类分析、潜在外来物种检测分析、配图及中文描述。更多实用型分析内容,检测更精准,更适合中国科研用户。

产出数据产出稳定、快速、准确

凌恩生物引入华大智造DNBSEQ-G99测序平台,采用华大智造核心的DNBSEQ测序技术,依据其高准确性、低重复序列、低标签跳跃等优势,打造凌恩生物eDNA metabarcoding检测项目专属实验及分析流程,助力科研用户取得准确的检测结果、精准分析生态构成、实时监测环境变化。

G99测序平台除了具有PE300等多样的读长选择,以其极致的测序速度、灵活简单的上机体验、通量适宜的载片规格,完美地解决了在16S等测序服务中凑样困难、交付周期长等痛点问题。G99广泛多样的应用场景,将持续赋能高通量测序技术在生态环境领域的快速发展。

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