1992年，横琴经济开发区管委会挂牌；2009年，设立横琴新区；2014年，设立中国（广东）自由贸易试验区珠海横琴新区片区；2021年，成立横琴粤澳深度合作区 。
       2025年1月2日 通告表示，合作区各相关单位新核发的证照应规范使用“横琴粤澳深度合作区”或“广东省横琴粤澳深度合作区”字样，不再使用“珠海市横琴粤澳深度合作区”“珠海市横琴”“珠海市香洲区横琴镇”“珠海市横琴新区”等字样。
      合作区各相关单位应有序开展证照变更工作，做好各项服务保障，简化变更换证程序。对已核发的证照，在有效期内可正常使用，不强制要求变更。

来源：广东省人民政府横琴粤澳深度合作区工作办公室