随着测序技术的不断发展,高通量测序技术已经成为基因组、转录组、表观等领域的重要研究工具。该技术全流程操作较为繁琐,为了提高湿实验环节的效率,准确性和稳定性,众多实验室已引入自动化核酸提取仪和高通量自动化建库仪,解决了手工操作一大难题。然而在看似简单的文库均一化和Pooling环节,因每个样本移液体积不同和移液逻辑不规律,一度成为实验人员最头疼的步骤。为此,华大智造携手爱基百客推出自动化解决方案:基于华大智造MGISP-960高通量自动化样本制备系统进行建库后,利用华大智造AlphaTool移液机器人完成均一化/Pooling实验,助力基因组学和转录组学研究。
测评方案
01测试应用场景
基因组/转录组文库构建。
02测评方案以及结果判断标准
A
测评方案:基于MGISP-960分别对96例DNA/RNA进行自动化建库,手动定量。接下来,利用AlphaTool分别对96例文库进行均一化和Pooling,后上机测序以及分析。
B
评判标准:计算实际测序数据量和理论测序数据量偏差,CV≤15%为合格。
03MGISP-960测评配置方案
A
MGISP-960配置方案:
B
MGISP-960配置2基因组DNA建库台面布局:96样本/run
C
MGISP-960配置2转录组RNA建库台面布局:96样本/run
04AlphaTool测评配置方案
A
AlphaTool配置方案:
B
AlphaTool文库均一化&Pooling台面布局:
样本通量:96例样本/Run
样本放置区:POS7(96孔PCR板)
稀释液放置区:POS4(96孔深孔板)
均一化产物放置区:POS8(96孔PCR板)
200 μl吸头放置区:POS1和POS2
样本通量:96例样本/Run
样本放置区:POS8(96孔PCR板)
Pooling产物放置区:POS12(搭配1.5ml离心管适配器)
50 μl吸头放置区:POS1
05实验流程
06测试结果
分别针对96例DNA/RNA,利用 MGISP-960 进行自动化建库,文库产出平均值为60 ng/ul,符合建库要求。
针对192例文库利用AlphaTool进行均一化和Pooling,实际测序数据量与理论测序数据量平均偏差在11.6%,符合标准;另测序结果显示Mapping Rate为98.6%、GC含量为49.3%,Q20为99.2%、Q30为97.4%,各性能指标表现优异。
目前,公司实验室自动化领域的产品主要分为样本前处理产品方向、样本制备系统产品方向以及通用检测平台产品方向。其中,作为一款高精度的桌面级自动化移液机器人,华大智造AlphaTool移液机器人可灵活组合多种功能模块和适配器,广泛应用于多组学、合成生物学、基因治疗、药物研发、CRO服务等众多领域。
关于爱基百客
武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客)是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。公司办公面积逾3000m2,员工已达到百余人,业务覆盖全国,核心团队来自国内知名高校和基因测序公司。公司先后引入ChIP、ATAC-seq、CUT&Tag、单细胞(进口、国产多平台)、DNBSEQ-T7和STOmics时空组学等实验平台,同时配备MGISP-960和AlphaTool等自动化设备。
运营至今合作科研客户超2000家,涵盖国内知名科研院所、高校及相关企业。多项合作成果发表在Science、Cancer Cell、Circulation、Nature Communications和Plant Cell等国际顶级期刊,广受客户好评,成为国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。爱基百客将秉承服务至上的理念,发挥自身优势,期待与海内外科研学者精诚合作,共探生命百科全书。
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