东北制药被诸多投资者不看好，主要是因其在业绩、债务、管理等方面存在问题，具体如下：
- 业绩增长失速：东北制药营收连续多年下滑，2022 年营收同比下降 6.42%，2023 年同样下降 6.42%，2024 年前三季度营收 61.34 亿元，同比下降 4.22%。净利润增长也逐渐乏力，2024 年前三季度净利润同比下降 5.37%。
- 盈利能力下滑：2022 年至 2024 年前 9 月，东北制药的销售毛利率分别为 38.96%、40.68%、34.53%，呈下滑趋势，同期销售净利率从 4.05% 降至 3.59%，公司盈利能力变差。
- 行业竞争加剧：东北制药在维生素类、抗感染类等领域虽有丰富产品线，但市场竞争激烈，其市场份额受到挤压。同时，主要产品维生素 C、磷霉素钠等因全球供应过剩，价格持续低迷，利润空间被进一步压缩。
- 集采政策影响：国家药品集中采购政策对其营收结构产生深远影响，尽管有产品中选集采，但 “以价换量” 效应未能完全抵消价格降幅对利润的侵蚀，在传统仿制药领域的盈利模式难以为继。
- 研发投入不足：2024 年其研发投入占比仅 1.98%，显著低于行业平均水平。传统仿制药研发进展缓慢，创新药与仿制药双轮驱动战略尚未形成协同效应，在创新药赛道竞争力滞后。
- 并购风险较大：东北制药收购鼎成肽源 70% 股权切入细胞免疫治疗市场，但鼎成肽源核心管线处于早期研发阶段，短期内难以带来收益，且自身负债高企，并入后会增加东北制药财务压力。
- 债务压力沉重：截至 2024 年 9 月 30 日，东北制药资产负债率高达 63.1%，总负债 91.44 亿元，应付账款 13.4 亿元，供应链支付压力大，货币资金仅 50.78 亿元，资金调度压力大，还面临被执行金额近亿元的情况，财务风险高。
- 司法纠纷不断：截至 2025 年 3 月，东北制药累计被执行金额达 9760 万元，2025 年新增 3 条被执行记录。至少 2 家全资子公司沦为 “失信被执行人”，旗下子公司还存在虚开发票、商票逾期等问题，严重影响公司市场形象和融资能力。
- 高管频繁变动：2024 年东北制药核心管理层经历了四次大变动，董秘、常务副总经理、副总经理、财务总监等关键岗位负责人相继离职，影响公司战略落地，让市场对其经营稳定性产生担忧。
- 环保问题拖累：2021 年东北制药因 VOCs 排放违规、固废处理不当等问题连续收到 8 张环保罚单，罚款总额达 87 万元。其作为辽宁省重点排污单位，需持续投入资金升级污染防治设施，影响现金流，且环境信用评分行业垫底，可能影响其环保资质和项目审批。
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