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- 日本农水省4机构偷拿中国稻种事件：2025年6月27日，日本Lievdoor网站报道，日本农林水产省下属农业环境技术研究所、食品产业技术综合研究机构等4个研究机构，曾将从中国偷偷带入日本的稻种进行实验性栽培研究，违反日本《植物防疫法》。这些稻种入境时未申报和检疫，过去几年间此类违法案例多达70起。

- 日本三井物产“种子间谍”事件：2025年3月，黑龙江省国家安全厅通报了一起“涉外种质资源窃密案”。日本三井物产株式会社自2004年起，通过“农业技术合作”项目，系统性盗取中国寒地水稻种质资源。其雇佣的“技术顾问”吉田浩二被查获携带23.7GB加密文件，内含黑龙江水稻研究所3.2万份育种材料原始数据。三井物产还试图将盗取的寒地水稻基因植入转基因大豆，反向垄断中国东北黑土地适应性作物专利。

- 中国杂交水稻亲本种子走私案：2025年8月，据央视报道，国内某农业科技公司总经理朱某，受利益诱惑，与日本情报机构合作，先后违规出售5种严禁出口的杂交水稻亲本种子。2023年，合肥海关拦下了其试图运往日本的种子，随后牵出17人的跨境间谍网。2024年1月，合肥中院以向境外非法提供情报罪判处朱某有期徒刑1年6个月。