近日,上海序祯达生物科技有限公司(以下简称:序祯达生物)实验室在华大智造DNBSEQ-T7平台上完成了Olink Explore HT产品的适配验证,实验及测序后的数据经过Olink Proteomics(以下简称:Olink)官方验证,得到了100%样本通过QC的好成绩,标志着Olink蛋白组学与DNBSEQ平台兼容取得了新进展,也意味着DNBSEQ-T7平台成功拓展蛋白组学应用。通过序祯达生物、Olink、华大智造三方的合作,为终端用户带来了更多的选择和更好的使用体验。

图1. Olink Explore HT检测实验流程图(测序平台:DNBSEQ-T7)验证内容

本次验证采用了66例健康男性及66例健康女性的血浆样本,通过Explore HT标准实验流程进行了实验并完成了文库构建,使用MGIEasy Olink文库环化套装将文库环化后上机DNBSEQ-T7平台进行测序(测序策略:SE66,测序时间约5小时),同时在其原有测序平台上机测序,通过比较NPX值的分布情况对不同平台的产出效果进行对比,结果如下:

图2. 不同测序平台NPX值分布的对比

Olink Explore HT文库在DNBSEQ-T7与原有平台的NPX值分析对比结果显示两个平台的结果具有极高的一致性。

此外,验证还选择了12例已知的在性别间显著差异表达的蛋白来验证DNBSEQ-T7平台产出的结果。其中包括了一些在生殖发育中承担重要作用的蛋白, 如INSL3、EDDM3B 和 TEX101。结果发现这12种蛋白的浓度在男女样本的浓度均与经验结果一致,同时在DNBSEQ-T7及原有平台上检测这些蛋白时获得了高度一致的结果(如下图)。图3. 部分男女间差异蛋白在DNBSEQ-T7的NPX值以及不同平台的检测结果比较

关于三方合作的

序祯达生物Olink蛋白组学平台

从2021年序祯达生物与Olink建立合作伙伴关系,并成为Olink在中国的首批合作实验室之一,序祯达生物开始采用Olink专有的邻位延伸分析技术(Proximity Extension Assay, PEA),赋能端对端的多组学临床研究,以加速中国精准医学发展进程。2023年,序祯达生物与华大智造签署了战略合作协议,拓展了原有测序模式的可及性。序祯达生物也是国内首家可提供Olink Explore、Target、Flex及Focus全系列产品的服务商,是国内首家通过Olink Target 48/96和Olink Explore质控标准的一致性验证的服务商,一直以来致力于提供满足国际标准的高质量的检测数据和服务。在Olink项目经验方面,已成功满足超过23种样本的检测服务,Olink Explore平台检测样本数也已达数万例,无论是检测经验还是交付质量,均处于国内领先地位。序祯达生物创始人兼首席执行官孙乐乐博士表示:“序祯达生物是一家专业提供测序技术服务和多组学研究解决方案的服务型平台企业,多年来一直追求卓越的质量控制标准,拥有多台高通量测序仪,在测序服务方面一直走在行业前列。序祯达生物也是Olink国内首家服务商,2022年成为首家通过Olink Target 48/96和Olink Explore一致性验证的中国服务商,今年年初,又率先通过了Olink Explore HT检测的国内外实验室一致性验证评估且获得了国内首家官方认证,是Olink国内的具备国际质量的服务商。很荣幸在序祯达生物的平台可以见证Olink Explore数据能在华大智造的DNBSEQ-T7上产出且通过官方的QC认证,未来,多组学、测序将有更多的可能性,让我们共同期待。”

华大智造副总裁、中国区总经理彭欢欢表示:“此前,我们对DNBSEQ-T7的性能进行了全面升级,通量更高、速度更快、数据质量更佳,全方位赋能多组学研究发展。此次适配,将助力序祯达生物为其客户提供更优质、更高效、更专业的技术检测服务,为蛋白组技术及应用的发展注入强大动力。”

关于Olink及Olink Explore

Olink Proteomics创立于瑞典乌普萨拉,致力于突破蛋白检测在“多重能力/特异性”、“灵敏度”和“检测通量”等方面的综合瓶颈,进而实现超灵敏多重蛋白标志物检测、无偏靶向蛋白质组学和精准蛋白组学,以帮助蛋白标志物的发现、药物研发、转化医学、以及让“多组学整合”真正切实可行。Olink现已覆盖100%主要信号通路,实现生物学意义上的超灵敏无偏靶向蛋白组学(兼容各种样本类型,对传统方法无法胜任的血浆血清等体液样本尤其适用)。

Olink Explore产品通过发现新颖且具有生物学相关性的蛋白生物标志物,以赋能基因组学研究扩展。Explore系列产品一直处于多靶点蛋白组学检测的前沿,通过与测序平台结合而具有超高的特异性和高通量能力。该前沿方法通过一对寡核苷酸独特标记的抗体对靶向蛋白识别结合,以在最小样本需求下,保证蛋白丰度测量中的高特异性和高灵敏度。Explore HT 新品进一步扩展了Explore的功能,可高通量完成在172个样本上同时检测超过 5,400 种蛋白。其检测范围已100%覆盖了反应途径(Reactome)中所有顶层通路,为广泛而深入蛋白组研究提供了基础。

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(华大智造)

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